故事紧接着上一部展开。菊川玲二（生田斗真 饰）接受了上级布置的新任务——接近并取得黑社会头目轰周宝（岩城滉一 饰）的信任，找到后者犯罪的证据。一场意外的发生让玲二得到了进入轰周宝家中做他的贴身保镖的机会，在那里，玲二见…

　　故事将从沉睡在福萨马格纳的古代化石集合在一起，变成巨大的怪兽并前往东京的背景下展开。人类将其视为自然灾害，只有妖怪们注意到了真相，开始担心未来。这样下去世界就会灭亡。能够封锁这一现象的是继承了传说中妖怪猎人血统的琦玉…

　　在GPS与芹泽军团的恶战之后，铃兰高中进入短暂的和平期。芹泽多摩雄（山田孝之 饰）让出老大宝座，泷谷源治（小栗旬 饰）则持续向恐怖的林田惠（深水元基 饰）发起冲击。8个月时间转瞬即逝，铃兰与宿敌凤仙学院的风波再起。　　两年…

菊川玲二（生田斗真）是刷新了警校建校以来最差成绩，把写检讨当成家常便饭的万年吊车尾。他有一丢丢好色却率真热情。某一日他被任命为卧底“鼹鼠”。按照命令他混入了日本最可怕的黑道组织，并定下目标要将领头大佬轰周宝捉拿归案。这次…